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新闻公告
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化学进展 2022, No 2
  
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图中描述了副本交换分子动力学(REMD)作为增强采样算法在蛋白质功能性构象变化模拟上的应用。REMD理论严格且采样效率高,极大地帮助了生物大分子构象采样和结合自由能计算等难题的解决。近年来对传统REMD方法的优化方兴未艾,正如“宝葫芦”内的无尽乾坤,各类REMD新方法如雨后春笋般涌现,百家争鸣。本综述从REMD的原理出发回顾了各类 REMD方法的变形策略,以助于对各类REMD方法的理解、应用和继续改进。