化学进展

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化学生物学中识别与组装的若干问题

沈家骢,吴玉清

化学进展. 2007, 19(012): 1839-1843.

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沈家骢,吴玉清. 化学生物学中识别与组装的若干问题[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1839-1843.

Shen Jiacong^{1,2 *} Wu Yuqing¹
. Molecular Recognition and Self-assembly in Chemical Biology[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1839-1843.

化学与生物学的交叉与融合产生了新学科——化学生物学，开拓了化学和生物学研究的新领域，使人类得以从分子水平来阐释生命过程，揭示生命的奥秘。分子识别和组装是体系的构筑与功能集成的基础，也是自然界生物进行信息存贮、复制和传递的基础，以此来研究构筑具有特定生物学功能的超分子体系，对揭示生命现象和过程具有重要意义。本文结合我们的研究工作从（1）谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)模拟与底物识别；（2）医用再生材料与活性支架；（3）类病毒颗粒的组装与解组装3个方面讨论了化学生物学中的识别与组装的意义。
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钌(II)多吡啶配合物与DNA相互作用研究^*

巢晖,高峰,计亮年

化学进展. 2007, 19(012): 1844-1851.

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巢晖,高峰,计亮年. 钌(II)多吡啶配合物与DNA相互作用研究^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1844-1851.

Chao Hui^** 　Gao Feng 　Ji Liangnian^**. DNA Interactions with Ruthenium(II) Polypyridyl Complexes[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1844-1851.

DNA是遗传信息的携带者和基因表达的物质基础，金属配合物与DNA的相互作用研究已受到广泛关注，成为生物无机化学的重要研究内容之一。本文简要评述了钌(II)多吡啶配合物在DNA识别、断裂及拓扑异构酶抑制方面的研究情况。
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免疫分析与细胞检测新原理与新方法研究^*

严枫,鞠熀先

化学进展. 2007, 19(012): 1852-1860.

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严枫,鞠熀先. 免疫分析与细胞检测新原理与新方法研究^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1852-1860.

Yan Feng¹ Ju Huangxian^2**.
Novel Concepts and Approach of Immunoassay and Cellular Analysis
[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1852-1860.

将分析化学与临床诊断相结合，发展临床检测新原理、新方法已成为人类健康的前沿领域之一，其中免疫分析，特别是多标志物同时免疫检测新方法的发展，与细胞检测已成为人们关注的课题。本文综述了近3年来这方面的研究进展, 并简要介绍了免分离、准无试剂和全无试剂安培免疫分析，空间分辨多通道安培芯片，底物区带分辨、通道分辨和通道-底物区带二维分辨化学发光免疫分析等多种免疫分析新概念，细胞检测与表面增殖监测、细胞毒效应研究与药敏检测新方法，对其在肿瘤临床诊断中的应用也作了总结。
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半导体荧光量子点标记技术^*

林毅,谢海燕,张志凌,田智全,庞代文

化学进展. 2007, 19(012): 1861-1865.

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林毅,谢海燕,张志凌,田智全,庞代文. 半导体荧光量子点标记技术^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1861-1865.

Lin Yi, Xie Haiyan, Zhang Zhiling, Tian Zhiquan, Pang Daiwen^**. Fluorescent Semiconductor Quantum Dots for Biolabeling^*[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1861-1865.

生命体系中化学、生物信息的活体、原位、实时、动态和高灵敏获取，是当前生命科学研究中迫切需要解决的关键问题之一，发展相关的新技术与新方法至关重要。半导体荧光量子点因其优异的荧光特性可望在解决此类难题中发挥重要作用而日益受到关注。本文将根据我们课题组多年来的研究工作经验，就半导体荧光量子点标记技术的相关基础问题、在生物医学领域中的应用以及发展前景等做简要评述。
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蛋白质的化学全合成^*

李娟,郑基深,沈非,方葛敏,郭庆祥,刘磊

化学进展. 2007, 19(012): 1866-1882.

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李娟,郑基深,沈非,方葛敏,郭庆祥,刘磊. 蛋白质的化学全合成^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1866-1882.

Li Juan^1,2 Zheng Jishen¹ Shen Fei¹ Fang Gemin¹ Guo Qingxiang² Liu Lei^1,2**. Chemical Synthesis of Proteins[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1866-1882.

含有非天然氨基酸的蛋白质（如翻译后修饰蛋白质、修饰有探针分子的蛋白质等）是化学生物学中重要的生理活性分子。这些分子难以通过生物表达来获取，而必须使用化学方法来合成。半胱氨酸肽片段连接方法是目前应用于蛋白质化学全合成中的一种重要方法，该方法能够在温和的水溶液中高效地实现肽片段的连接，从而生成天然或者非天然的蛋白质。本文系统地综述了半胱氨酸肽片段连接方法的基本原理，详细讨论了近年来人们对该方法的一些重要改进。最后又介绍了该方法在几类重要的蛋白质分子合成中的代表性应用。
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新型甾体缀合物的设计合成及活性研究*

金培元,巨勇

化学进展. 2007, 19(012): 1883-1895.

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金培元,巨勇. 新型甾体缀合物的设计合成及活性研究*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1883-1895.

Jin Peiyuan, Ju Yong^**. Design, Synthesis and Biological Activity of novel Steroidal Bioconjugates[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1883-1895.

甾体化合物是一类生物体中广泛存在并起重要功能的生物分子。其特殊结构使这类化合物具有亲脂性，膜亲合性以及与低密度脂蛋白的特异性结合等性能。利用这些特性设计合成各种药物分子的甾体缀合物，可增加药物分子的脂溶性，提高跨膜渗透能力，在特定组织中的分布以及甾体缀合物自身具有独特的生物活性，对探索新型生物活性分子具有重要意义。本文介绍了近年来在设计合成新型甾体缀合物领域的研究进展，包括甾体药物缀合物、含磷甾体缀合物、作为离子通道和分子载体的缀合物及甾体二聚缀合物等。
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寡糖合成中的“预活化”策略*

耿轶群,叶新山

化学进展. 2007, 19(012): 1896-1902.

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耿轶群,叶新山. 寡糖合成中的“预活化”策略*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1896-1902.

Geng Yiqun, Ye Xinshan^**. Oligosaccharide Synthesis by Pre-Activation Strategy[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1896-1902.

寡糖及其缀合物因其重要的生物学功能而日益受到人们的关注，由于糖链结构的复杂性与多样性，寡糖的化学合成具有很大的挑战性。为了减少合成及分离步骤，提高寡糖合成的效率，糖基化策略十分重要。"一釜合成法"由于进行多个连续的糖基化反应但不需分离中间体而具有很大优势，但传统"一釜法"在设计单糖模块时需要进行精细复杂的保护基操作和离去基调整而影响其合成效率。"预活化"寡糖合成策略不依赖于糖基供体与糖基受体的活性差异，无需复杂的保护基操作，所有偶联反应在同一条件下一釜完成，实现了寡糖的高效、快速合成。本文在简要介绍传统"一釜合成法"的基础上，对"预活化"策略的研究进展进行综述，重点介绍"预活化"策略的基本原理，发展过程及其在生物活性寡糖合成上的应用。
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动态组合化学最新进展^*

陈玉岩,刘刚

化学进展. 2007, 19(012): 1903-1908.

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陈玉岩,刘刚. 动态组合化学最新进展^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1903-1908.

Chen Yuyan, Liu Gang^**. Advance in Dynamic Combinatorial Chemistry[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1903-1908.

动态组合化学是组合化学的一个新兴分支，在药物先导化合物的发现中有广阔的应用前景。在动态组合化学库中，利用靶标分子的诱导结合作用，通过可逆共价反应，能够选择性的筛选到与靶标分子存在强相互作用的优势化合物。本文按照动态组合化学方法简介、动态组合化学中的可逆共价化学、动态组合化学库的分类、动态组合化学库筛选方法的研究进展及动态组合化学在药物先导化合物发现过程中的应用等5个方面对动态组合化学进行了概述。
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大环多胺及其金属配合物与DNA的相互作用^*

周立宏,王娜,余孝其

化学进展. 2007, 19(012): 1909-1918.

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周立宏,王娜,余孝其. 大环多胺及其金属配合物与DNA的相互作用^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1909-1918.

Zhou Lihong, Wang Na, Yu Xiaoqi^*. The Interaction of Macrocyclic Polyamine derivatives and Their Complexes with DNA[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1909-1918.

本文综述了近年来基于大环多胺及其金属配合物与DNA相互作用的研究进展，着重介绍本课题组在有关单双核、多核以及功能化大环多胺衍生物及其金属配合物与DNA相互作用方面的研究和发现，并对其在化学核酸酶方面的应用进行了讨论。在单双核大环多胺衍生物方面，我们分别合成了以吡啶、苯环、咪唑、三氮唑为侧臂的单核大环多胺金属配合物，同时合成了以刚性桥相连的双核配合物和以柔性链相连的双核配合物。并研究这些单双核大环多胺与DNA的相互作用，发现以刚性链相连的双核大环多胺金属配合物具有很好的切割DNA的性质，可以在低浓度、短时间内切断DNA。在功能化大环多胺方面，我们合成了含有碱基、PNA单体、咪唑鎓盐、冠醚、二茂铁等功能化基团的大环多胺衍生物及金属配合物，并研究了其与DNA的相互作用。在多核大环多胺方面，我们合成了基于大环多胺的寡聚物，研究发现该类物质可与DNA形成复合物，从而有效地保护DNA免于酶解。
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生物催化在绿色化学和新药开发中的应用^*

陈振明,刘金华,陶军华

化学进展. 2007, 19(012): 1919-1927.

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陈振明,刘金华,陶军华. 生物催化在绿色化学和新药开发中的应用^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1919-1927.

Zhenming Chen¹, Jinhua Liu ², Tao, Junhua^2,3**. Biocatalysis for Green Chemistry and Drug Development[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1919-1927.

近年来生物技术领域有了突破性进展，如: 公共基因数据库(GenBank)和蛋白质数据库(PDB)中序列的指数增长，高效基因克隆和表达平台的建立，可有效改进生物催化剂专一性、选择性和稳定性的酶定向进化技术的应用。这些进展使生物催化在化学合成中日趋重要[1]。本文综述了生物催化在如下领域的成功应用：在药物生产中用于开发经济的化学酶法合成工艺，在绿色化学领域中最大程度的减少废物的产生和危险试剂的应用，在天然化学领域中对天然产物进行修饰以发现具有更好生物活性的新药物。
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仿硒酶研究进展

刘俊秋,罗贵民,沈家骢

化学进展. 2007, 19(012): 1928-1938.

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刘俊秋,罗贵民,沈家骢. 仿硒酶研究进展[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1928-1938.

Liu Junqiu^*, Luo Guimin, Shen Jiacong. Progress in Selenoenzyme Mimics[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1928-1938.

硒是人体中必需的微量元素，它与各种疾病和人类健康息息相关。硒在生物体内以硒代半胱氨酸形式表现其生理活性和功能。为了探索硒在硒蛋白中结构和功能关系并可能发展成硒相关的适用药物，人们付出许多努力来发展硒蛋白模拟化学。由于硒酶—谷胱甘肽过氧化物酶（GPX）重要的抗氧化作用以及潜在的药用价值，国际上广泛开展了对它的人工模拟研究。本文对近年来硒酶模拟化学和生物学相关研究进展进行了综述。
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先导化合物的发现——整合计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试方法^*

叶德举,罗小民,沈建华,朱维良,沈旭,蒋华良,柳红

化学进展. 2007, 19(012): 1939-1946.

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叶德举,罗小民,沈建华,朱维良,沈旭,蒋华良,柳红. 先导化合物的发现——整合计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试方法^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1939-1946.

Ye Deju¹, Luo Xiaomin¹, Shen Jianhua¹, Zhu Weiliang¹, Shen Xu^1,2, Jiang Hualiang^1,2, Liu Hong^1**
. Discovering Potential Drug Leads via Docking, Synthesis and Bioassay[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1939-1946.

先导化合物的发现在药物研究中起关键作用。基于分子对接的虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术，已成为一种与高通量筛选互补的方法，广泛应用于先导化合物的发现中。本文将结合本课题组的研究实例，综述了通过计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试相结合的方法来发现先导化合物的一些研究工作。
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生物催化与新药研究和开发

陈依军,吴旭日

化学进展. 2007, 19(012): 1947-1954.

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陈依军,吴旭日. 生物催化与新药研究和开发[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1947-1954.

Chen Yijun^* Wu Xuri. Biocatalysis in Drug Discovery and Development[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1947-1954.

生物催化具有条件温和、效率高、选择性强、副产物少等特点，因此生物催化在新药的研究和开发中得到广泛的应用；此外，利用生物技术对生物催化剂进行改造优化，将使其能够更好地应用于新颖的生产工艺。本文对此领域的进展作一简单介绍和概述。
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以肿瘤凋亡相关蛋白和基因为靶的小分子^*

范健,张华林,谭春燕,蒋宇扬

化学进展. 2007, 19(012): 1955-1964.

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范健,张华林,谭春燕,蒋宇扬. 以肿瘤凋亡相关蛋白和基因为靶的小分子^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1955-1964.

Fan Jian,Zhang Hualin, Tan Chunyan, Jiang Yuyang^**. Small Molecules Targeting Tumor Apoptosis Related Proteins and Genes[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1955-1964.

细胞凋亡的调控作为治疗肿瘤的新兴手段，近年来受到广泛关注。本文对细胞凋亡途径中的重要靶点，包括Bcl-2,IAP,p53等的结构及作用机制作了较详尽的阐述，并且总结了针对上述不同靶点的对细胞凋亡进行调控的化学小分子的研究。在对这些研究现状进行分析的基础上,对该研究领域下一步的发展方向提出了我们的观点。
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利用表面上的小分子控制细胞黏附

刘定斌,谢赟燕,邵华武,蒋兴宇

化学进展. 2007, 19(012): 1965-1971.

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刘定斌,谢赟燕,邵华武,蒋兴宇. 利用表面上的小分子控制细胞黏附[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1965-1971.

Liu Dingbin^1,2, Xie Yunyan², Shao Huawu^1*, Jiang Xingyu^2*. Using Small Molecules on Surfaces to Control Cell Adhesion[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1965-1971.

细胞黏附是重要的生理过程,多细胞生物体中大部分种类的细胞都依赖于在表面的黏附而进行其正常生理活动。细胞的黏附需要固定在表面的有机分子（例如蛋白质或多肽）作配体。我们利用表面小分子模拟蛋白质或多肽作为配体，通过与细胞膜上受体结合，促进细胞黏附到表面。聚乙二醇（PEG）可以抵抗细胞在表面的黏附，我们利用含有PEG的表面小分子来调节细胞黏附。细胞表面的受体与胞外基质表面的配体结合是一个动态过程，在适宜时间和空间发生的时候，细胞就会产生运动和迁移，细胞的迁移也是重要的生理过程。本文主要介绍近年来利用小分子的表面化学和微纳米结构控制细胞在表面的黏附和迁移。
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迈克尔反应受体分子化学生物学研究

赵勤实,从玉文

化学进展. 2007, 19(012): 1972-1976.

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赵勤实,从玉文. 迈克尔反应受体分子化学生物学研究[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1972-1976.

Zhao Qinshi^1*, Cong Yuwen². Michael Reaction Acceptor Molecule in Chemical Biology[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1972-1976.

迈克尔受体是烯键或炔键与吸电子基团共轭相连形成的官能团，含有这样官能团的化学小分子能与亲核试剂发生迈克尔加成反应，因此称为迈克尔反应受体分子。迈克尔反应受体分子是一类重要的生理活性分子，它们直接或间接参与许多生命过程，同时也是细胞中许多信号转导途径的调节者，在化学生物学研究中起着重要的作用。本文对迈克尔反应受体分子化学生物学研究进展进行了综述。
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神经肽FF的构效关系研究^*

方泉,张邦治,王锐

化学进展. 2007, 19(012): 1977-1985.

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方泉,张邦治,王锐. 神经肽FF的构效关系研究^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1977-1985.

Fang Quan, Zhang Bangzhi, Wang Rui^**. Structure-Activity Relationship Studies of Neuropeptide FF[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1977-1985.

多肽在机体中具有重要的生理功能，并且它具有化学合成和修饰的便利性，因此它吸引了越来越多的化学、生物学及其交叉领域研究人员的研究兴趣。神经肽FF(NPFF)作为阿片调节肽在阿片耐受等药理学方面具有重要的调节作用，然而迄今为止仍缺乏NPFF受体高选择性的激动剂和拮抗剂，从而阻碍了NPFF药理学功能及其作用机制的研究。本文简述了NPFF的发现，并综述了近几年来在NPFF的前体、受体和生理学功能等方面所取得的最新进展，结合本实验室的工作重点介绍了NPFF构效关系方面的研究，并展望了该研究方向今后的发展趋势。
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含铁蛋白介导的铁转运分子机制

孙雪松,何庆瑜

化学进展. 2007, 19(012): 1986-1990.

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孙雪松,何庆瑜. 含铁蛋白介导的铁转运分子机制[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1986-1990.

Sun Xuesong, He Qingyu^*. Molecular Mechanism of Iron Transport Mediated by Iron-containing Proteins[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1986-1990.

铁是生命体必需的微量元素，因为它是一些重要功能酶的协同因子。这些功能酶有着广泛的功能，从呼吸作用到核酸的复制。但是，当铁含量多于细胞稳态的时候，它将产生对机体有毒的羟基。生物体已经发展了自身的调控机制，包括铁的摄取，存储和输出来控制细胞内的铁处于平衡态。二价阳离子转运蛋白，铁输出蛋白和hephaestin参与小肠吸收，转铁蛋白和转铁蛋白受体参与铁的摄取和转运，铁蛋白可以存储铁，铁调控蛋白的功能是调节铁代谢。这篇文章综述着重阐述了含铁蛋白介导的铁传递机制。
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来源于天然产物的基质金属蛋白酶（MMPs）抑制剂

房学迅,扬金刚,史秀娟

化学进展. 2007, 19(012): 1991-1998.

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房学迅,扬金刚,史秀娟. 来源于天然产物的基质金属蛋白酶（MMPs）抑制剂[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1991-1998.

Fang Xuexun* Yang Jingang Shi Xiujuan. Matrix Metalloproteinase Inhibitors from Natural Product[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1991-1998.

基质金属蛋白酶（MMPs）参与一系列重大疾病的病理过程，基质金属蛋白酶抑制剂具有广阔的药用前景。本文概述了基质金属蛋白酶抑制剂的研究历史和最新的研究理念。重点回顾总结了天然产物中基质金属蛋白酶的活性抑制成分和对基质金属蛋白酶转录表达抑制的天然产物成分以及这些化合物的抗癌效果。
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可诱导核酸交联剂的研究进展^*

翁小成,翁立伟,白明慧,周泱泱,周翔

化学进展. 2007, 19(012): 1999-2005.

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翁小成,翁立伟,白明慧,周泱泱,周翔. 可诱导核酸交联剂的研究进展^*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 1999-2005.

Weng Xiaocheng, Weng Liwei, Bai Minghui, Zhou Yangyang, Zhou Xiang**. Studies of Inducible DNA Cross-Linking Agents[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 1999-2005.

如何选择性的破坏癌细胞DNA链结构的药物，一直是研究的热点，可诱导核酸交联剂在增加药物靶标选择性方面有很多的优点，利用氧化、还原或光诱导产生的DNA交联作用，在临床治疗中具有重要意义，本文就可诱导核酸交联剂的最新研究进展做了评述。
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载脂蛋白E与阿尔兹海默病的相关研究进展*

刘倩,吴为辉,李人望,郑一哲,赵玉芬,李艳梅

化学进展. 2007, 19(012): 2006-2012.

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刘倩,吴为辉,李人望,郑一哲,赵玉芬,李艳梅. 载脂蛋白E与阿尔兹海默病的相关研究进展*[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 2006-2012.

Liu Qian, Wu Weihui, Li Renwang, Zheng Yizhe, Zhao Yufen, Li Yanmei**. Advances in Research of Apolipoprotein E and Alzheimer’s Disease[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 2006-2012.

载脂蛋白E（Apolipoprotein E,ApoE ）的等位基因ε4是阿尔兹海默病（Alzheimer’s disease,AD）主要的危险遗传因子，它主要与晚发型以及散发型阿尔兹海默病相关。阿尔兹海默病的两个主要病理学特征均被发现与ApoE 有着极为密切的关系。本文介绍了ApoE在阿尔兹海默病中所起的主要作用的研究进展以及目前国内外关于基于ApoE的阿尔兹海默病相关药物研究。
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小分子细胞自噬诱导剂用于治疗神经退行性疾病

杨雯隽,温龙平

化学进展. 2007, 19(012): 2013-2016.

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杨雯隽,温龙平. 小分子细胞自噬诱导剂用于治疗神经退行性疾病[J]. 化学进展, 2007, 19(012): 2013-2016.

Yang Wenjun, Wen Longping*. Small Molecule Autophagy Inducers: A New Therapeutic Paradigm for Neural Degeneration Diseases[J]. Progress in Chemistry, 2007, 19(012): 2013-2016.

大量突变和错误折叠的蛋白质在细胞内聚集是神经退行性疾病产生的基础，研究发现一些小分子可以通过引起细胞自噬而降解细胞内聚集的突变蛋白，为治疗神经退行性疾病提供了新的方法，本文对神经退行性疾病的发病机理，细胞自噬的机理以及对神经退行性疾病的作用进行了综述。

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